芳园书室位于马湾的田寮，在20世纪20至30年代兴建，原址为「陈氏书斋」。早年芳园书室以传统方式教学服务本区居民。日占时期时书室停办，战后方再重开。
第二次大战后，马湾学生人數不断上升，故50年代时村民在芳园书室南面另建新校，取名「马湾公立芳园学校」。原校称作「大芳园」，新校称作「小芳园」。自此这兩所学校为马湾子弟提供教育，贡献良多，直至关闭。
芳园书室是岛上硕果仅存的战前学校，印证马湾昔日教育的发展，并呈现新界的书室演变成新式村校的过程。书室曾被纳入发展局推出的第一期活化历史建筑伙伴计划，于2013年被活化为旅游及教育中心暨马湾水陆居民博物馆。该场地2017年起由政府接管。
芳园书室为一幢兩层高的长方型建筑，中西合璧。前庭及花园由矮墙围起，开有拱形闸口。这幢独立建筑采用中式折衷主义建筑风格，以麻石山墙承托硬山式屋顶。地下入口处为凹斗式，上方有一露台。一楼开敞式露台由几何纹饰通花扶栏围起。平屋顶建有护墙，中间有楣饰。护墙上有「芳园书室」四个模塑大字，两边为花瓣及几何图案纹饰。半圆形的楣饰绘上花卉图案，顶部有一圆球，两侧各有一条短柱。