芳園書室位於馬灣的田寮，在20世紀20至30年代興建，原址為「陳氏書齋」。早年芳園書室以傳統方式教學服務本區居民。日佔時期時書室停辦，戰後方再重開。
第二次大戰後，馬灣學生人數不斷上升，故50年代時村民在芳園書室南面另建新校，取名「馬灣公立芳園學校」。原校稱作「大芳園」，新校稱作「小芳園」。自此這兩所學校為馬灣子弟提供教育，貢獻良多，直至關閉。
芳園書室是島上碩果僅存的戰前學校，印證馬灣昔日教育的發展，並呈現新界的書室演變成新式村校的過程。書室曾被納入發展局推出的第一期活化歷史建築伙伴計劃，於2013年被活化為旅遊及教育中心暨馬灣水陸居民博物館。該場地2017年起由政府接管。
芳園書室為一幢兩層高的長方型建築，中西合璧。前庭及花園由矮牆圍起，開有拱形閘口。這幢獨立建築採用中式折衷主義建築風格，以麻石山牆承托硬山式屋頂。地下入口處為凹斗式，上方有一露台。一樓開敞式露台由幾何紋飾通花扶欄圍起。平屋頂建有護牆，中間有楣飾。護牆上有「芳園書室」四個模塑大字，兩邊為花瓣及幾何圖案紋飾。半圓形的楣飾繪上花卉圖案，頂部有一圓球，兩側各有一條短柱。